El enfoque pedagógico del Postgrado en la Universidad Internacional Tres Fronteras, se orienta sobre la base de fundamentos metodológicos, cuya acción pone énfasis en el proceso de aprendizaje que se centra en la intervención dirigida hacia el análisis de problemas y propuestas de solución que implica una enseñanza dinámica y flexible.
La formación de los estudiantes en el curso de Postgrado abarca el saber teórico, el saber práctico, el saber científico y el saber técnico. Se toman en cuenta las condiciones ambientales del entorno donde se llevan a cabo el desarrollo programático del Proyecto Educativo. Además, se considera relevante las inclusiones previas como condiciones para fortalecer las experiencias, adquirir nuevas competencias, habilidades y destrezas, mediante un aprendizaje innovador y práctico.
En lo que hace a las competencias y capacidades, las estrategias metodológicas y evaluativas, y los métodos se enmarcan en una visión académica holística para que los cursantes del Postgrado puedan dar respuestas a las cuestiones que se presenten en el trabajo diario, además saber desarrollarse con recursos creativos y prácticos de acuerdo a las exigencias académicas. Los pilares fundamentales de la formación e innovación de los egresados universitarios en relación al Posgrado se enmarca en los ejes estratégicos que son la investigación, formación (docencia) y la extensión universitaria que se dan como funciones integradas para responder al encargo social, en consonancia con el proyecto educativo de la Universidad.